MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 37127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_000854	CTC	2	6	259863	259868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431015
5503	NC_000854	CTC	2	6	259887	259892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431015
5504	NC_000854	TCC	2	6	259898	259903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431015
5505	NC_000854	CTT	2	6	259917	259922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118431015
5506	NC_000854	C	6	6	259957	259962	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5507	NC_000854	ACC	2	6	260002	260007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5508	NC_000854	G	6	6	260097	260102	0 %	0 %	100 %	0 %	14600666
5509	NC_000854	TCC	2	6	260150	260155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600666
5510	NC_000854	ACC	2	6	260216	260221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14600666
5511	NC_000854	GCTG	2	8	260232	260239	0 %	25 %	50 %	25 %	14600666
5512	NC_000854	TTG	2	6	260248	260253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14600666
5513	NC_000854	TCT	2	6	260274	260279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600666
5514	NC_000854	GAG	2	6	260347	260352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600666
5515	NC_000854	CCTC	2	8	260364	260371	0 %	25 %	0 %	75 %	14600666
5516	NC_000854	CTG	2	6	260372	260377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600666
5517	NC_000854	AGG	2	6	260466	260471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600666
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5519	NC_000854	AGC	2	6	260672	260677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600666
5520	NC_000854	CTC	2	6	260687	260692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600666
5521	NC_000854	CCTC	2	8	260700	260707	0 %	25 %	0 %	75 %	14600666
5522	NC_000854	TCC	2	6	260708	260713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600666
5523	NC_000854	GA	3	6	260774	260779	50 %	0 %	50 %	0 %	14600666
5524	NC_000854	GGA	2	6	260812	260817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600666
5525	NC_000854	CTCCAG	2	12	260818	260829	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	14600666
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5527	NC_000854	CTCC	2	8	260950	260957	0 %	25 %	0 %	75 %	14600666
5528	NC_000854	CTCC	2	8	260970	260977	0 %	25 %	0 %	75 %	14600666
5529	NC_000854	GGC	3	9	261004	261012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14600666
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5531	NC_000854	GGA	2	6	261086	261091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600666
5532	NC_000854	TCCCC	2	10	261155	261164	0 %	20 %	0 %	80 %	14600666
5533	NC_000854	GAGG	2	8	261229	261236	25 %	0 %	75 %	0 %	14600666
5534	NC_000854	CTC	2	6	261287	261292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600666
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5538	NC_000854	AG	3	6	261508	261513	50 %	0 %	50 %	0 %	14600666
5539	NC_000854	CTC	2	6	261566	261571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600666
5540	NC_000854	CTCC	2	8	261595	261602	0 %	25 %	0 %	75 %	14600666
5541	NC_000854	GCCT	2	8	261606	261613	0 %	25 %	25 %	50 %	14600666
5542	NC_000854	CTC	2	6	261629	261634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600666
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5545	NC_000854	CTT	3	9	261679	261687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600666
5546	NC_000854	CTG	3	9	261773	261781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600666
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5549	NC_000854	CAC	2	6	261835	261840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14600666
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5556	NC_000854	GCT	2	6	262146	262151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431016
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5625	NC_000854	CCT	2	6	264786	264791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600670
5626	NC_000854	GGCT	2	8	264797	264804	0 %	25 %	50 %	25 %	14600670
5627	NC_000854	TCC	2	6	264826	264831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600670
5628	NC_000854	GCT	2	6	264852	264857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600670
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5634	NC_000854	TCG	2	6	265099	265104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600670
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5645	NC_000854	CCTC	2	8	265592	265599	0 %	25 %	0 %	75 %	14600670
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5657	NC_000854	AGG	2	6	266215	266220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600670
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5671	NC_000854	TAAAA	2	10	266932	266941	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5720	NC_000854	GA	4	8	269179	269186	50 %	0 %	50 %	0 %	118431018
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5722	NC_000854	GCCC	2	8	269216	269223	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5723	NC_000854	AGG	2	6	269329	269334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5724	NC_000854	GGCT	2	8	269353	269360	0 %	25 %	50 %	25 %	14600674
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5728	NC_000854	G	6	6	269625	269630	0 %	0 %	100 %	0 %	14600674
5729	NC_000854	CT	3	6	269631	269636	0 %	50 %	0 %	50 %	14600674
5730	NC_000854	CT	3	6	269689	269694	0 %	50 %	0 %	50 %	14600674
5731	NC_000854	CAT	2	6	269695	269700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600674
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5736	NC_000854	CAT	2	6	269816	269821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600674
5737	NC_000854	CAGCA	2	10	269857	269866	40 %	0 %	20 %	40 %	14600674
5738	NC_000854	CCTC	2	8	269893	269900	0 %	25 %	0 %	75 %	14600674
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5743	NC_000854	GGC	2	6	270180	270185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14600674
5744	NC_000854	TGGC	2	8	270195	270202	0 %	25 %	50 %	25 %	14600674
5745	NC_000854	AAG	2	6	270276	270281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14600674
5746	NC_000854	TGG	2	6	270304	270309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14600674
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5748	NC_000854	CT	3	6	270326	270331	0 %	50 %	0 %	50 %	14600674
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5750	NC_000854	GAA	2	6	270431	270436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14600674
5751	NC_000854	TAT	2	6	270477	270482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118431019
5752	NC_000854	CCT	2	6	270494	270499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431019
5753	NC_000854	CCT	2	6	270519	270524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431019
5754	NC_000854	TC	3	6	270567	270572	0 %	50 %	0 %	50 %	118431019
5755	NC_000854	GCC	2	6	270586	270591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431019
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5781	NC_000854	TAGT	2	8	271715	271722	25 %	50 %	25 %	0 %	118431019
5782	NC_000854	CGA	2	6	271745	271750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431019
5783	NC_000854	CCG	2	6	271783	271788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431019
5784	NC_000854	TC	3	6	271875	271880	0 %	50 %	0 %	50 %	118431019
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5787	NC_000854	GA	3	6	272122	272127	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5842	NC_000854	AGAGA	2	10	273881	273890	60 %	0 %	40 %	0 %	14600678
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5874	NC_000854	CCA	2	6	275218	275223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118431020
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5879	NC_000854	AGC	2	6	275463	275468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431020
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5994	NC_000854	TCT	2	6	280200	280205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118431026
5995	NC_000854	TA	3	6	280249	280254	50 %	50 %	0 %	0 %	118431026
5996	NC_000854	CTG	2	6	280279	280284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431026
5997	NC_000854	GTC	2	6	280286	280291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431026
5998	NC_000854	ATC	2	6	280337	280342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431026
5999	NC_000854	CAG	2	6	280345	280350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431026
6000	NC_000854	ACCA	2	8	280477	280484	50 %	0 %	0 %	50 %	118431026

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